Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms