Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A3P48751 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms