Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ME1P48163 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms