Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms