Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETFBP38117 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms