Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms