Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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