Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ITGB6P18564 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ITGB6P18564 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ITGB6P18564 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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