Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms