Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZBED1O96006 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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