Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms