Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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ERVV-1B6SEH8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ERVV-1B6SEH8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ERVV-1B6SEH8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ERVV-1B6SEH8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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