Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms