Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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