Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms