Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms