Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms