Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX27Q96L92 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms