Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HGDQ93099 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HGDQ93099 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms