Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms