Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC71Q8N4P6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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