Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE4Q8N205 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE4Q8N205 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE4Q8N205 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNE4Q8N205 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms