Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms