Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTN4Q8IWV2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms