Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LRRC28Q86X40 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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