Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms