Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms