Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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