Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms