Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SIX1Q15475 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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SIX1Q15475 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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