Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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