Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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