Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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