Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms