Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 HSFY1-204ENST00000382856 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DEFB105B-201ENST00000335510 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CA5BP1-204ENST00000380336 843 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms