Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms