Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms