Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTAP49354 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms