Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ME1P48163 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ME1P48163 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ME1P48163 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ME1P48163 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ME1P48163 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms