Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA4P48058 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA4P48058 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms