Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGP37231 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGP37231 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms