Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPB2P35606 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPB2P35606 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms