Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms