Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms