Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB2P26583 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms