Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTSSP25774 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms