Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KB1P23443 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms