Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD247P20963 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD247P20963 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD247P20963 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD247P20963 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD247P20963 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CD247P20963 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD247P20963 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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