Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GM2AP17900 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms