Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms